En producción: Baselys
Software para laboratorios: de la muestra al informe El laboratorio no espera al software.
Cada paso manual entre la muestra y el informe es tiempo perdido y un lugar donde algo puede salir mal. Construimos sistemas que automatizan el análisis de principio a fin y dejan registro de qué se hizo con cada muestra.
- Muestra
- FASTQ del laboratorio, secuenciado con Nanopore (gen 16S).
- 12 etapas de análisis
- Calidad, taxonomía con NanoASV y SILVA, ecología, función con PICRUSt2 y comparación con la línea base. Nadie ejecuta un script.
- Revisión humana
- El pipeline se detiene dos veces hasta que alguien aprueba.
- Informe en PDF
- Con huella SHA-256 y reimpresión verificable.
Qué resolvemos
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Carga de muestras
El laboratorio sube los archivos que producen sus equipos desde el navegador.
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Análisis automatizado
Los pasos del análisis corren solos, en el orden correcto y en un entorno aislado.
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Resultados visuales
Gráficos claros para el equipo técnico, no solo tablas de números.
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Informes en PDF
Informes listos para entregar, generados por el sistema con los datos de cada muestra.
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Trazabilidad
Cada informe emitido queda registrado y se puede verificar que no fue alterado.
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Honestidad en los datos
Si un dato no alcanza para dar un resultado, el informe lo dice en lugar de inventarlo.
Automatizar no es dejar de revisar
En Baselys, el sistema que construimos para el laboratorio Genetox, el análisis de cada muestra pasa por 12 etapas. Casi todas corren solas, pero el sistema se detiene en dos momentos para que un especialista decida: después del control de calidad de las lecturas, para elegir con qué parámetros seguir, y después de la curva de rarefacción, para aprobar el resultado o repetir esa parte con otro ajuste.
La máquina hace el trabajo repetitivo. Las decisiones que requieren criterio las sigue tomando una persona.
Control y trazabilidad
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Cuando algo falla, se sabe por qué
La muestra queda marcada con la causa en lenguaje claro y el análisis se reintenta desde la etapa que falló, sin empezar de cero.
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Cada resultado se puede reconstruir
Cada corrida guarda los parámetros, la versión del análisis y la de la base de referencia, y cada cambio queda con quién lo hizo.
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Control de calidad con muestras conocidas
El laboratorio corre muestras de composición conocida y el sistema mide qué tanto coincide lo detectado con lo esperado.
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Una referencia propia
Los resultados se comparan contra una población de referencia del propio laboratorio, con versiones que se congelan y se aprueban antes de usarse.
Cómo es un proyecto
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Reunión inicial
Nos muestras tu flujo actual: qué entra, qué herramientas usas y qué sale. 30 minutos, gratis.
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Propuesta
En menos de 48 horas: alcance, etapas y costo de cada una.
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Primero el análisis
Automatizamos los pasos que hoy se hacen a mano y los validamos con tus datos reales, antes de dibujar pantallas.
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Informe y trazabilidad
El informe sale del sistema, con registro de cada emisión.
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Acompañamiento
Seguimos con ajustes y mejoras, en los términos que acordemos en la propuesta.
Preguntas frecuentes
¿Trabajan con los formatos de mis equipos?
Partimos de los archivos que ya generan tus equipos. En Baselys, por ejemplo, el sistema procesa directamente los FASTQ de la secuenciación Nanopore.
¿Pueden integrar herramientas científicas existentes?
Sí. Baselys usa NanoASV con la base SILVA y PICRUSt2 dentro de un contenedor dedicado; el sistema las orquesta para que nadie tenga que ejecutarlas a mano.
¿Quién valida los resultados antes de que salgan?
Una persona del laboratorio. El sistema se detiene en los puntos de revisión y los resultados tienen que ser aprobados por un revisor.
¿Solo trabajan con secuenciación 16S?
Baselys es nuestro caso de 16S con Nanopore. Si tu laboratorio usa otro tipo de análisis, lo revisamos en la reunión inicial: lo que se repite es el método (automatizar, revisar y dejar registro), no la herramienta.
¿Cómo empezamos?
Con una reunión de 30 minutos para entender tu flujo de trabajo. En menos de 48 horas tienes una propuesta con alcance, etapas y costo.